190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2207 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
328 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 
301 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 
287 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  38.44 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.64 
 
 
292 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 
289 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  36.33 
 
 
292 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  34.8 
 
 
293 aa  185  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  34.32 
 
 
291 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  34.8 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  36.18 
 
 
287 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  36.48 
 
 
291 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  35.2 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  35.18 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  35.55 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 
296 aa  178  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34.01 
 
 
290 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 
287 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 
291 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  32.21 
 
 
292 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 
296 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  33.67 
 
 
303 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  33.11 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  34.75 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  33.77 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  33.22 
 
 
288 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.49 
 
 
300 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  34.41 
 
 
295 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  35.2 
 
 
282 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  35.47 
 
 
295 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  35.31 
 
 
287 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  32.79 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.67 
 
 
284 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  33.44 
 
 
288 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 
284 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  36.93 
 
 
290 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 
276 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 
285 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  32.81 
 
 
301 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 
290 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 
278 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  35.44 
 
 
296 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 
280 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  31.62 
 
 
287 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.48 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.22 
 
 
299 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  31.4 
 
 
302 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 
284 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  34.14 
 
 
280 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  32.2 
 
 
301 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  29.87 
 
 
308 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  32.68 
 
 
286 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 
281 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 
285 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  29.75 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  30.87 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  34.73 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 
278 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  33.99 
 
 
264 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  33.44 
 
 
287 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 
290 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 
290 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 
319 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.83 
 
 
281 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 
309 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  28.24 
 
 
284 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  29.97 
 
 
288 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 
295 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  29.77 
 
 
279 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 
293 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.86 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.65 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  28.67 
 
 
284 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  29.83 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  27.18 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  30.8 
 
 
285 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  31.28 
 
 
276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 
293 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 
286 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.47 
 
 
279 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  29.77 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 
283 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  29.67 
 
 
294 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  30.98 
 
 
299 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>