200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5737 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  67.75 
 
 
295 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  66.06 
 
 
295 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  62.04 
 
 
288 aa  361  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  60.89 
 
 
292 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  60.22 
 
 
303 aa  350  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  60.58 
 
 
288 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  59.78 
 
 
288 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  57.66 
 
 
288 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  59.49 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  58.76 
 
 
290 aa  329  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  56.83 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.74 
 
 
292 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  57.41 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  57.58 
 
 
288 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  55.51 
 
 
296 aa  308  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  60.66 
 
 
300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  55.72 
 
 
302 aa  304  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  52.55 
 
 
296 aa  298  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  52.81 
 
 
294 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  51.26 
 
 
310 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  53.62 
 
 
290 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  55.47 
 
 
299 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  54.2 
 
 
287 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  52.38 
 
 
308 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  50.18 
 
 
285 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  50.73 
 
 
302 aa  268  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  53.68 
 
 
301 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  49.22 
 
 
292 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  45.69 
 
 
289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  43.77 
 
 
301 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  43.38 
 
 
287 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  41.64 
 
 
291 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  40.38 
 
 
283 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
293 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  40.61 
 
 
293 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  42.58 
 
 
291 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 
282 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  39.55 
 
 
410 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  41.6 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  41.76 
 
 
282 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 
278 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 
287 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  38.2 
 
 
287 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  39.27 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  36.13 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 
284 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  37.13 
 
 
296 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  36.78 
 
 
283 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 
291 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 
289 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 
293 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  34.75 
 
 
285 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.96 
 
 
284 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.8 
 
 
284 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 
295 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37 
 
 
278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  38.29 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  37.13 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.59 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
282 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.21 
 
 
279 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.97 
 
 
283 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 
287 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  35.15 
 
 
284 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  35.74 
 
 
319 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
282 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  35.55 
 
 
297 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  46.02 
 
 
212 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  35.17 
 
 
262 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  34.53 
 
 
293 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
286 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  36 
 
 
293 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  36.25 
 
 
294 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  40.17 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 
278 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 
292 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  36.75 
 
 
290 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  32.6 
 
 
284 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
279 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  35.06 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 
286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  35.66 
 
 
287 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  34.62 
 
 
264 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5407  hypothetical protein  34.23 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  32.84 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  36.02 
 
 
290 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  31.8 
 
 
283 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>