190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  100 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  40.43 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  42.34 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20570  Helix-turn-helix protein  39.79 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  32.36 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  28.29 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.62 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  30.47 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  32.95 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  29.1 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  30.22 
 
 		 410 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.67 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  33.69 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  29.33 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.5 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  28.98 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  28.9 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  27.94 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  32.09 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  30.26 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  27.6 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  28.99 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  30.42 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  28.11 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  32.34 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  29.01 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  29.89 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  31.6 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  28.94 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  30.5 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0418  transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 328 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  28.68 
 
 		 268 aa  89  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  28.47 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.61 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  27.11 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  27.14 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  28.19 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  29.23 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  29.89 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  31.02 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  27.31 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.94 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.12 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  30.42 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  25.91 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.09 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  32.02 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  28.68 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.2 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  30.43 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  28.98 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  27.41 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  27.17 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.64 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  28.51 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  30.4 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  26.69 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  27.04 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  28.31 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  24.28 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  31.28 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.81 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>