172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0707 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  296  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 282 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 296 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  40.54 
 
 		 281 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 282 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  38.51 
 
 		 291 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.89 
 
 		 284 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 278 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  36.99 
 
 		 288 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  39.04 
 
 		 285 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.84 
 
 		 283 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 288 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 		 288 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  39.16 
 
 		 287 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  37.93 
 
 		 294 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 291 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  39.26 
 
 		 293 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 		 285 aa  97.1  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  39.86 
 
 		 410 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 293 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 292 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  41.01 
 
 		 291 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 289 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 301 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 287 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  35.17 
 
 		 283 aa  89.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 286 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  34.03 
 
 		 289 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  35.17 
 
 		 282 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  36.3 
 
 		 269 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 		 292 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  34.06 
 
 		 255 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  38.06 
 
 		 283 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 284 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  34.97 
 
 		 287 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  35.92 
 
 		 285 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 290 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 267 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  38.19 
 
 		 287 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  33.08 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  34.48 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.46 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  32.37 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.46 
 
 		 278 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 295 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 287 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  36.3 
 
 		 254 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  35.77 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 279 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  34.03 
 
 		 286 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  32.19 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  32.37 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  35.88 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  38.66 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  34.17 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.34 
 
 		 281 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  38.06 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 280 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  33.59 
 
 		 255 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  34.06 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6373  hypothetical protein  50.62 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20570  Helix-turn-helix protein  32.14 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  34.51 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  36.97 
 
 		 295 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  38.26 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  46.24 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  30.82 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2267  putative DNA-binding protein  32.81 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0115008  hitchhiker  0.00542384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  29.92 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  32.48 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  34.69 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.71 
 
 		 267 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  32.24 
 
 		 293 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  32.33 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  34.13 
 
 		 301 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  29.5 
 
 		 284 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  31.61 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>