158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0263 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0263  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.18 
 
 		 267 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 272 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 287 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  43.36 
 
 		 270 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 293 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  40.37 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  40.71 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  38.6 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  36.7 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 280 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  33.62 
 
 		 303 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  34.75 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 274 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  39.66 
 
 		 294 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  33.62 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6857  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0788983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  34.95 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  33.63 
 
 		 290 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 281 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 301 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  67  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 410 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  33.64 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  36.61 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  33.04 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  34.17 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  36.61 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  37.14 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.36 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.45 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  37.04 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 284 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 284 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 289 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  31.86 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  31.19 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  34.29 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  33.64 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  34.86 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.17 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  31.86 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 287 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  32.11 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  36.36 
 
 		 291 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 278 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0707  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.09 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 279 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  36.04 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  35.54 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  32.73 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4490  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  38.74 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  36.61 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  32.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.46 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 		 328 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.68 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  30.36 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  33.96 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.96 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.09 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  26.96 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>