36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0980 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 445 aa  856    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.12 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 457 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  36.03 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  46.03 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  31.54 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.78 
 
 		 146 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  26.74 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1947  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.505699  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  25.38 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  26.62 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  33.59 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 770 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4540  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129106  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  28.02 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1296  hypothetical protein  40.24 
 
 		 791 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.28 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  31.16 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  45.45 
 
 		 281 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  31.87 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 493 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>