28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7489 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  30.5 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.1 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  28.52 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  29.55 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  27.35 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  28.8 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  28 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  26.74 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 503 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  31.15 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  31.13 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  26.74 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  26.89 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  24.06 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  26.62 
 
 		 503 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  24.32 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  27.91 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  24.15 
 
 		 519 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  28.35 
 
 		 288 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.19 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  30.38 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>