36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0264 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  813    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  36.36 
 
 
369 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  34.55 
 
 
514 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  32.62 
 
 
363 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  30.34 
 
 
418 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  36.98 
 
 
403 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  34.94 
 
 
288 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  63.64 
 
 
431 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  61.36 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  29.7 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
335 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 
503 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  27.46 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  27.56 
 
 
484 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  29.97 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  41.38 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  24.06 
 
 
400 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  27.51 
 
 
419 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  38.64 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  27.08 
 
 
537 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  25.9 
 
 
503 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  26.74 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  25.87 
 
 
478 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  26.84 
 
 
503 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  25.54 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  24.9 
 
 
487 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  23.55 
 
 
468 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  25.61 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  25.62 
 
 
467 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  26.42 
 
 
554 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  28.77 
 
 
502 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 
441 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>