57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0512 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 401 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  36.79 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  34.98 
 
 		 420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  37.96 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  28.03 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.88 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.13 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  30.89 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.46 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  22.82 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  28.57 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  27.33 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  27.45 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  23.73 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  25.99 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.84 
 
 		 579 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  27.64 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  30.71 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  33.06 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  29.41 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  27.9 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  27.37 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  26.39 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  29.66 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.38 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  25.94 
 
 		 530 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  25.45 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  28.51 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0318  putative transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 90 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  33.04 
 
 		 249 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  27.15 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  23.89 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  30.32 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  34.06 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  28.99 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  27.8 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  30.18 
 
 		 503 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  28.29 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  30.81 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  24.6 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  27.42 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  27.94 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  24.63 
 
 		 497 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  24.55 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>