41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6440 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  611  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  40.86 
 
 
526 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  42.57 
 
 
397 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  37.85 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  34.86 
 
 
412 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 
420 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 
441 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.87 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  32.14 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 
449 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  30.19 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  32.16 
 
 
468 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  33.52 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  29.32 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  29.36 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
449 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  30.66 
 
 
510 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  27.74 
 
 
447 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  28.84 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  31.38 
 
 
467 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  31.22 
 
 
405 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  30.93 
 
 
453 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 
388 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  28.57 
 
 
452 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.75 
 
 
433 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 
412 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  26.42 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  24.56 
 
 
456 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 
488 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  24.39 
 
 
460 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  27.86 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  32.66 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  31.15 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  25.42 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  31.97 
 
 
487 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  22.8 
 
 
414 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  25.53 
 
 
457 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  26.55 
 
 
437 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  27.7 
 
 
461 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>