38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0751 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 
414 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  36.65 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  30.5 
 
 
411 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 
412 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  47.92 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  34.95 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  50.62 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  27.1 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.78 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  26.85 
 
 
526 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.67 
 
 
477 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.64 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  29.11 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  26.8 
 
 
468 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  24.75 
 
 
467 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  25.76 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  37.62 
 
 
444 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.77 
 
 
579 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  37.62 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  30.11 
 
 
469 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  23.84 
 
 
478 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  26.75 
 
 
452 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.72 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  24.7 
 
 
487 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.86 
 
 
515 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  26.97 
 
 
497 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  23.53 
 
 
453 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  21.88 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  27.04 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  28.57 
 
 
510 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  25 
 
 
457 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>