85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4805 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  960    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  47.7 
 
 
452 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  46.61 
 
 
447 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  45.34 
 
 
467 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  37.02 
 
 
433 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  37.43 
 
 
453 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  95.4 
 
 
221 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  38.18 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  34.45 
 
 
469 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  37.63 
 
 
468 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 
441 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  32.59 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  29.82 
 
 
524 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  31.44 
 
 
510 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.68 
 
 
461 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  28.21 
 
 
456 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  32.42 
 
 
579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  33.15 
 
 
487 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.21 
 
 
432 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  28.03 
 
 
460 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 
530 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  35.04 
 
 
449 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  31.83 
 
 
477 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  30.52 
 
 
526 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 
449 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  32.73 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  30.33 
 
 
437 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  33.22 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  28.22 
 
 
398 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  28.46 
 
 
475 aa  90.5  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1605  hypothetical protein  93.33 
 
 
116 aa  90.1  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  52.22 
 
 
161 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 
412 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  45.36 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.64 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  44.44 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  34.87 
 
 
249 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  44.44 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  26.68 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  28.76 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  26.68 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  29.24 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  42.27 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  45.54 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  28.53 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.13 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  39.63 
 
 
202 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  42.7 
 
 
290 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  28.16 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  27.07 
 
 
502 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  29.26 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.93 
 
 
444 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  29.36 
 
 
311 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  47.14 
 
 
327 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  26.26 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  46.03 
 
 
549 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  38.04 
 
 
107 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  25.93 
 
 
461 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  28.14 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  34.96 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  27.43 
 
 
554 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  26.2 
 
 
363 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 
507 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 
503 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  26.16 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.25 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  24.88 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  25.87 
 
 
509 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  27.5 
 
 
475 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 
433 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  27.09 
 
 
288 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  28.03 
 
 
434 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.02 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  30.85 
 
 
143 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.97 
 
 
418 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 
503 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  26.32 
 
 
331 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>