77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0731 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 418 aa  827    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  43.23 
 
 		 457 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  37.13 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  31.61 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  26.37 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  28.04 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  32.1 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  32.38 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  29.67 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  30.03 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  31.29 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.03 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  28.57 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  28.25 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  27.39 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  24.87 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  28.69 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  29 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.35 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.82 
 
 		 267 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 277 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1947  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.505699  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  27.66 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  28.76 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  26.55 
 
 		 519 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  25.99 
 
 		 526 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  42.62 
 
 		 274 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  29.22 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  28.46 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  26.92 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  25.9 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  27.82 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  28.37 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  30.67 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 270 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  24.91 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  52.27 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  26.7 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0517  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  29.61 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.97 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  35.62 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  41.46 
 
 		 182 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1056  helix-turn-helix domain-containing protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  39.73 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 182 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  25.09 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 		 104 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 116 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 209 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  41.86 
 
 		 493 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 282 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 183 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 130 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2272  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 68 aa  43.1  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.555397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.39 
 
 		 269 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1906  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.18 
 
 		 128 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>