37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4608 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  46.69 
 
 
514 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  41.64 
 
 
288 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  39.62 
 
 
369 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  39.37 
 
 
418 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  37.85 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  32.62 
 
 
411 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 
335 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  29.14 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.21 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  26.1 
 
 
503 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  28.92 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.39 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  28.64 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  33.7 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.09 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  31.74 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  33.15 
 
 
503 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.65 
 
 
477 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  28.85 
 
 
537 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  34.36 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  26.51 
 
 
519 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.5 
 
 
433 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  30.98 
 
 
457 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  31.13 
 
 
478 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  24.11 
 
 
460 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  25.58 
 
 
519 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  25.24 
 
 
554 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  30.46 
 
 
452 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 
457 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  24.91 
 
 
526 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  28 
 
 
447 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>