43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2840 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1008    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  76.19 
 
 
484 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  52.32 
 
 
519 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  54.79 
 
 
519 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  39.81 
 
 
537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  43.26 
 
 
503 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  86.67 
 
 
535 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  37.76 
 
 
526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  50.76 
 
 
342 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  79.58 
 
 
346 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  78.52 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  34.34 
 
 
514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  34.64 
 
 
509 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  51.14 
 
 
181 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  57.81 
 
 
175 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  62.18 
 
 
255 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  87.65 
 
 
148 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  68.03 
 
 
565 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 
473 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  32.03 
 
 
434 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  27.87 
 
 
554 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.24 
 
 
503 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  29.8 
 
 
431 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  30.88 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  25.9 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  24.68 
 
 
418 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  25.1 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  28.37 
 
 
288 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  25.79 
 
 
363 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.28 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 
457 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 
412 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  34.26 
 
 
181 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 
507 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 
449 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.45 
 
 
228 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  28 
 
 
369 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  26.62 
 
 
400 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 
401 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  24.81 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  26.06 
 
 
403 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>