74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6151 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  86.83 
 
 		 449 aa  774    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 449 aa  895    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  34.57 
 
 		 487 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  32.58 
 
 		 526 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  39.29 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  36.65 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  37.09 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  31.98 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4914  hypothetical protein  64.77 
 
 		 279 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172157  hitchhiker  0.00523873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  33.11 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 469 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  33.88 
 
 		 432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  31.28 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1067  hypothetical protein  28.76 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119168  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  34.63 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  32.78 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  33.61 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.19 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 530 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  35 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  31.72 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  28.64 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 401 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  29.93 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  26.1 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  27.3 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  34.13 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  27.27 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  28.63 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.22 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  33.12 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  33.85 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  34.97 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  27.52 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  27 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  25.68 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  28.74 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  24.68 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  27.63 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  29.44 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  31.25 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  25.15 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  25.94 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  27.19 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  34.55 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  27.51 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  27.93 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  29.44 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  29.48 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  24.29 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  26.97 
 
 		 449 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  26.8 
 
 		 545 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  29.34 
 
 		 202 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  28.02 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  27.23 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  26.9 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  27.21 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.17 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  29.15 
 
 		 315 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>