42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0702 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  817    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  74.81 
 
 
418 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  50.96 
 
 
470 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  30.45 
 
 
403 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 
443 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  29.22 
 
 
441 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  46.79 
 
 
161 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 
443 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  32.02 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 
290 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  31.34 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  28.71 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  45.36 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  52.78 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  26.43 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  31.9 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  37.76 
 
 
497 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 
488 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
507 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.03 
 
 
432 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  30.2 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  55 
 
 
431 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  34.18 
 
 
549 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  30.77 
 
 
502 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 
449 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  25.8 
 
 
288 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  32.4 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  25.41 
 
 
537 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 
431 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  24.46 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>