35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0334 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  940    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  73.5 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 507 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  34.51 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  62.82 
 
 		 161 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  53.95 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.46 
 
 		 478 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  54.17 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  47.06 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  48 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  24.1 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  52.78 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  49.32 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  30.53 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  50.67 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  50.67 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  27.35 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  46.15 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  23.4 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  35.53 
 
 		 107 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  26.64 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  25.17 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  28.92 
 
 		 315 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  25.9 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  25.67 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  26.84 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>