17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4489 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  50.45 
 
 		 452 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  40.39 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  38.41 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  32.48 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  33.65 
 
 		 315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.75 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  28.27 
 
 		 477 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  26.72 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 507 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  30.96 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  25.81 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  29.48 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  26.17 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>