21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5529 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  36.96 
 
 		 549 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  32.08 
 
 		 107 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  42.67 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  44.29 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  36.71 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  47.14 
 
 		 478 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3401  hypothetical protein  50.94 
 
 		 120 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537957  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  40.58 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  39.53 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  31.11 
 
 		 443 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  33.73 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  34.52 
 
 		 497 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 443 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.63 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 443 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>