23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2079 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  326  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  56.77 
 
 		 403 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  50.98 
 
 		 470 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  62.82 
 
 		 475 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  50.51 
 
 		 290 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  49.48 
 
 		 418 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  51.11 
 
 		 443 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  46.79 
 
 		 405 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  47.78 
 
 		 443 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 392 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  52.22 
 
 		 478 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 282 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  48.81 
 
 		 497 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  41.24 
 
 		 443 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 460 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  45.83 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  34.02 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  70 
 
 		 431 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  35 
 
 		 549 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.9 
 
 		 444 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>