40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0340 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 
418 aa  831    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  74.81 
 
 
405 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  53.12 
 
 
470 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  35.04 
 
 
403 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 
443 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  31.14 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  49.48 
 
 
161 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  49.44 
 
 
290 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  29.66 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  54.17 
 
 
475 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  35.17 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  42.27 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.84 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.3 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  29.68 
 
 
487 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  41.98 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
507 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  40.58 
 
 
549 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  32.26 
 
 
107 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  60 
 
 
431 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  32.39 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  27.44 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 
463 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.07 
 
 
444 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  25.3 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  30.32 
 
 
503 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  26.99 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.622079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>