39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4907 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 433 aa  857    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.77 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  46.98 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  31.6 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  24.12 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  25.4 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  27.68 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  27.1 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  27.71 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  23.12 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  27.83 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  29.66 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  27.09 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  27.11 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.67 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  27.04 
 
 		 526 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1987  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00401079  normal  0.325189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.94 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  31.22 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  37.66 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  26.56 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 82 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 503 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.65 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  26.73 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>