59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  874    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  37.02 
 
 		 478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  41.21 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  41.18 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  39.37 
 
 		 467 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  38.49 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  29.36 
 
 		 524 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  34.24 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.07 
 
 		 432 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  32.54 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 469 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.4 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  28.95 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  30.16 
 
 		 579 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 530 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  25.42 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  24.33 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  27.88 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  31.1 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  46.51 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  27.51 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2887  hypothetical protein  30.8 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00393929  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  29.39 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  30.29 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  39.08 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  27.22 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  25.42 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  24.67 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.49 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  25.43 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  26.5 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  29.11 
 
 		 202 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  27.27 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  24.79 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.82 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  27.78 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  27.51 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.08 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  25.88 
 
 		 311 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  25.46 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  22.97 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  24.6 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  27.57 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  26.32 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  32.93 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>