18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1602 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  93.33 
 
 
478 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  48.72 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  47.67 
 
 
452 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  47.06 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  51.95 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  68.09 
 
 
407 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  36.56 
 
 
413 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
461 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  32.97 
 
 
453 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  31.37 
 
 
487 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 
432 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 
441 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 
449 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  33.72 
 
 
502 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  30.17 
 
 
449 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  44.58 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  43.9 
 
 
449 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>