61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8001 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  982    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  40.94 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  37.73 
 
 		 524 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  32.31 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  33.11 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  31.64 
 
 		 447 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  34.1 
 
 		 497 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  31.17 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.95 
 
 		 515 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  28.75 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  33.15 
 
 		 478 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  32.98 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  29.82 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  29.54 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  27.25 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  30.35 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  27.05 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  32.59 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  32.62 
 
 		 249 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  27.88 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.41 
 
 		 579 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  29.53 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  29.77 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  35.14 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.63 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  25.06 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  27.03 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  26.67 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  27.78 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  29.19 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  31.9 
 
 		 405 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  25.31 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  29.68 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  29.79 
 
 		 331 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  27.07 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  27.59 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.67 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  31.65 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  31.37 
 
 		 221 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  32.54 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  24.7 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.79 
 
 		 565 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  31.65 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  34.95 
 
 		 545 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  34.11 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  25.05 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  26.07 
 
 		 556 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1067  hypothetical protein  26.3 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119168  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  24.67 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>