38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3993 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  82.14 
 
 		 535 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  76.76 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  77.94 
 
 		 484 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  46.81 
 
 		 526 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  81.69 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  80.15 
 
 		 527 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  79.58 
 
 		 503 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  66.45 
 
 		 537 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  62.77 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  57.78 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  63.78 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  54.41 
 
 		 175 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  55 
 
 		 181 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  62.31 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  66.39 
 
 		 565 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  76.54 
 
 		 148 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  35.14 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  39.01 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  37.09 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  37.96 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.66 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  40.83 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  35.78 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  33.94 
 
 		 181 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  34.43 
 
 		 456 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  34.96 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  32.77 
 
 		 554 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 449 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  32.08 
 
 		 505 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  34.46 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  38.14 
 
 		 452 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 460 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  32.11 
 
 		 467 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 449 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>