57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8297 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  897    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  62.47 
 
 
467 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  51.44 
 
 
447 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  47.7 
 
 
478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  41.78 
 
 
469 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  39.78 
 
 
453 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  41.21 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  35.78 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  37.21 
 
 
457 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  39.93 
 
 
413 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  32.31 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  31.77 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  31.97 
 
 
460 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  32.54 
 
 
461 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  39.71 
 
 
449 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  30.26 
 
 
579 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 
449 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 
441 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  32.82 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  30.63 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  28.94 
 
 
456 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  29.97 
 
 
526 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 
530 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  28.23 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  29.25 
 
 
398 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.25 
 
 
515 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  47.67 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  30.4 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  29.64 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  29.02 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  36.99 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  28.51 
 
 
502 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  28.12 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  37.61 
 
 
249 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  28.09 
 
 
537 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  25.09 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  29.91 
 
 
288 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  27.46 
 
 
331 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.66 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  26.75 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  26.19 
 
 
554 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3947  hypothetical protein  35.44 
 
 
146 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1605  hypothetical protein  40.43 
 
 
116 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.76 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.11 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  29.45 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  38.14 
 
 
346 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 
507 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>