53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3968 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  891    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  41.06 
 
 		 487 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  37.05 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  36.26 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 530 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  34.36 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  39.03 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  33.43 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  31 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  32.68 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.91 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  29.54 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  28.85 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  32.42 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  34.28 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  31.8 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  34.65 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  33.52 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  33.23 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  29.93 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  36.36 
 
 		 249 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  31.49 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  27.54 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  31.29 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  28.96 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  39.01 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.93 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  30 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  26.46 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.27 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  26.33 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.93 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  26.07 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  27.65 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  28.15 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  27.51 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  27.39 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  30.98 
 
 		 363 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  28.21 
 
 		 545 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>