64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6314 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 443 aa  885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  93.68 
 
 		 441 aa  809    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  96.16 
 
 		 443 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  38.13 
 
 		 443 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  37.01 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  32.35 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  30.45 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  30.77 
 
 		 405 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  31.53 
 
 		 348 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.31 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  24.09 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  30.29 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  24.64 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  35.91 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  30.34 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  26.03 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  28.39 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  29.29 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  41.24 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.3 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  37.62 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  25.79 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  28.81 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  28.57 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  27.02 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  26.57 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.92 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  30.11 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  29.05 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  24.05 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  28.74 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  25 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  25.24 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  38.67 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  25.42 
 
 		 503 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  34.44 
 
 		 107 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  25.09 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  23.32 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  34.43 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  26.41 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  26.3 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1987  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00401079  normal  0.325189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  31.78 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  26.07 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  31.65 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0523  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 331 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  32.47 
 
 		 549 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  27.33 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  21.13 
 
 		 828 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6107  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  25 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  25.45 
 
 		 470 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  33.58 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>