19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0275 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  61.24 
 
 		 403 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  31.53 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  30.61 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  32.44 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  28.78 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  29.14 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  28.42 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0789  hypothetical protein  32.68 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.236873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5799  hypothetical protein  33.59 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.808848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  30 
 
 		 545 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  36.55 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  26.9 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  30.73 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  34.16 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  29.08 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  27.55 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>