16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4409 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  924    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  66.74 
 
 		 450 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  30.3 
 
 		 565 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  30.07 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  30.82 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  29.74 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  33.11 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  33.05 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  27.43 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.06 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 		 479 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  26.94 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  28.38 
 
 		 505 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>