17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1130 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  889    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  43.81 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  40.71 
 
 		 437 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  34.53 
 
 		 472 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  33.77 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  30.91 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  30.19 
 
 		 346 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  33.02 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  29.41 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  25.88 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  29.35 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  22.53 
 
 		 565 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>