19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3050 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  878    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  47.07 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  42.86 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  46.44 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  43.94 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 500 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  35.45 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  34.67 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  33.67 
 
 		 351 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  32.98 
 
 		 319 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0272  hypothetical protein  32.83 
 
 		 218 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  26.09 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  26.2 
 
 		 443 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3520  hypothetical protein  29.56 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  24.15 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  26.94 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  26.58 
 
 		 450 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>