12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4164 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  62.88 
 
 		 316 aa  335  9e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  34.82 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  33.02 
 
 		 443 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  32.98 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  33.66 
 
 		 439 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  35.56 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  35.56 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 500 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  34.84 
 
 		 472 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  31.01 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  30.11 
 
 		 565 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>