57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0051 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1128    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  51.74 
 
 		 514 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  63.5 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  64.71 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  32.68 
 
 		 519 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  59.62 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  64.18 
 
 		 255 aa  170  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  32.34 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  34.79 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  61.87 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  52.66 
 
 		 519 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  55.83 
 
 		 181 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  37.39 
 
 		 537 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  64.12 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  55.64 
 
 		 175 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  32.06 
 
 		 443 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  33.44 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  32.64 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  28.91 
 
 		 473 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  29.03 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  25.4 
 
 		 556 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  59.76 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  30.11 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  31.68 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  24.01 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  24.86 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  26.49 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  34.87 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  29.2 
 
 		 445 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  32.05 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  38.32 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  37.38 
 
 		 228 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  32.2 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  26 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  24.69 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 406 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  26.96 
 
 		 477 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  30.19 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  25 
 
 		 478 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  26.06 
 
 		 502 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  25.5 
 
 		 360 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  29.32 
 
 		 316 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  28.42 
 
 		 348 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  29.97 
 
 		 403 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  26.79 
 
 		 487 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  30.87 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  29.8 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.94 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  27.75 
 
 		 339 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  27.42 
 
 		 319 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  26.69 
 
 		 439 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  26.52 
 
 		 468 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>