17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2699 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  348  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  64.91 
 
 
181 aa  216  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  62.6 
 
 
519 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  59.7 
 
 
484 aa  161  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  55.32 
 
 
527 aa  150  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  50.31 
 
 
535 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  63.64 
 
 
255 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  54.41 
 
 
346 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  56.25 
 
 
514 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  52.73 
 
 
519 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  55.73 
 
 
509 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  57.81 
 
 
503 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  49.09 
 
 
526 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  55.97 
 
 
537 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  57.5 
 
 
565 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  54.43 
 
 
148 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  32.77 
 
 
505 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>