58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1817 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1026    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  80.34 
 
 		 535 aa  776    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  74.66 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  76.81 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  80.15 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  78.52 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  77.86 
 
 		 526 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  73.97 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  66.22 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  55.86 
 
 		 514 aa  156  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  55.94 
 
 		 181 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  39.72 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  55.32 
 
 		 175 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  38.31 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  58.2 
 
 		 255 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  58.33 
 
 		 509 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  63.11 
 
 		 565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  31.32 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  85.14 
 
 		 148 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  29.77 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  33.19 
 
 		 562 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  29.9 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 411 aa  87  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  28.21 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  34.53 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  32.24 
 
 		 383 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.13 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 401 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.32 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 402 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 406 aa  57  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.82 
 
 		 228 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  33.48 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 403 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  26.4 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  28.43 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  28.41 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 554 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  29.74 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  32.63 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>