48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8757 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 414 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  81.33 
 
 		 407 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  35.32 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  33.9 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  30.02 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.98 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  29.92 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  30.42 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  32.36 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 524 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  30.85 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 402 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  29.88 
 
 		 383 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  28.87 
 
 		 402 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  28.22 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  29.37 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  28.14 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  29.12 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.2 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  25.78 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  27.5 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  25.73 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  24.83 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 97 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  25.32 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  29.67 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  41.18 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>