43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1131 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  983    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  39.72 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  39.37 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  39.3 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  35.12 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  35.22 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  32.78 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  34.98 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  37.2 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.44 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  28.22 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  31.34 
 
 		 562 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  33.18 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  32.08 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  31.22 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  28.22 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  45.16 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.8 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  31.83 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  41.57 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  26.34 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  25.45 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>