69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 411 aa  824    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  38.11 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  34.56 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  32.67 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  36.33 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.1 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  29.95 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  34.11 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  36.76 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  36.02 
 
 		 562 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  29.85 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  30.59 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.67 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  26.58 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  30.43 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  26.96 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  28.94 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  33.77 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  27.13 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  27.43 
 
 		 337 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  29.77 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  28.1 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  35.05 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  28.21 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 125 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 		 143 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 203 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 112 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  40.35 
 
 		 143 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.63 
 
 		 317 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  30.85 
 
 		 107 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>