48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0010 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 401 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  66.08 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.99 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  30.46 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  30.66 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  31.09 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  31.81 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.59 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  30.3 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  29.97 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  27.09 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  28.79 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  28.64 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  26.01 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  29.64 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  30.21 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.64 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  31.35 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  31.72 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.5 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.74 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  26.6 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  25.71 
 
 		 337 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>