54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2850 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  885    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  69.21 
 
 		 562 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  50.67 
 
 		 350 aa  279  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  42.32 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  34.77 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 524 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  33.02 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 399 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.38 
 
 		 401 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 403 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 411 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  33.2 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  37.8 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  28.62 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  28.62 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  30.29 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  27.99 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3081  XRE family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 81 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.74 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  28.22 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3639  hypothetical protein  54.17 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  42.5 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  29.49 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  26.48 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  26.58 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  27.55 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  29.1 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  28.62 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.9 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  31.02 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  50.91 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.48 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>