50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3690 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 402 aa  796    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  66.08 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 524 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  32.27 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  28.68 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  31.83 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  30.3 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  29.04 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.71 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  29.72 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.64 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  28.46 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  31.71 
 
 		 527 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  29.39 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  29.14 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  31.07 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  30.1 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  30 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  29.88 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  30.66 
 
 		 535 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  24.7 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.53 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  27.31 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  40.23 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>