35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0133 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 405 aa  810    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.5 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  47.45 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  35.61 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 524 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  28.5 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.62 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.3 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  26.58 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  29.96 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  23.99 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  24.46 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  24.55 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  24.32 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  33.56 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  24.55 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  26.64 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  24.83 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  25.81 
 
 		 337 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  24.62 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  25.23 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  24.4 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>