74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1530 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 403 aa  807    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  82.88 
 
 		 403 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  41.34 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  37.15 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  30.97 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 407 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.5 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  29.74 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  27.43 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  29.14 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  27.15 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  26.85 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  31 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  25.25 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0301  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  26.46 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  28.68 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  30.17 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  24.38 
 
 		 562 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  30.57 
 
 		 527 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  25.12 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.68 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  24.94 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 174 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  27.39 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 217 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  47.92 
 
 		 124 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 192 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 76 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 76 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 201 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 528 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 123 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 143 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 219 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 181 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>