55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1631 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 401 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  48.51 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 407 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  33 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  31.41 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  28.82 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.35 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  27.51 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  28.24 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  29.4 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  31.41 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  27.3 
 
 		 383 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  28 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.5 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  27.25 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  24.64 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  28.12 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  28.97 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  23.53 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  28.29 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  26.58 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.47 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  33.55 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  25.42 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  32.52 
 
 		 535 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  24.64 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  29.1 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  26.75 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  25.59 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  25.91 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 104 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  32.97 
 
 		 216 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 104 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>