57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1330 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 404 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  45.18 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  37.09 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  35.81 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  36.41 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  29.97 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  31.45 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  29.56 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  30.18 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 524 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.7 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  31.92 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.2 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  29.93 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  31.67 
 
 		 562 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  30.47 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  27.91 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  30.23 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  26.85 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  31.18 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  30.96 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.27 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  30.61 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2233  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0669523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  29.55 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  26.46 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 197 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  26.52 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 528 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 197 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 112 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 215 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 90 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 106 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>