72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1756 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 409 aa  811    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 401 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  38.38 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  32.92 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  34.14 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 524 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  31.23 
 
 		 399 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  31.05 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  32.28 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.31 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  29.24 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  33.01 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  30.63 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  29.44 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  26.02 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  27.84 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  30.04 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  31.2 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  28.22 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1046  putative DNA-binding protein  44.05 
 
 		 87 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.32421  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  28.61 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.88 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  32.83 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  29.48 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  28.72 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.18 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0568  hypothetical protein  48 
 
 		 71 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  27.68 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  42.47 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 107 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 107 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  32.11 
 
 		 191 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 197 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 107 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 107 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 110 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  40.91 
 
 		 107 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>