52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4820 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  60.1 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 407 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  35.1 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  32.67 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.25 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  32.07 
 
 		 403 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  30.37 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  35.46 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 383 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  30.42 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  32.03 
 
 		 445 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  34.92 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  32.78 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  29.4 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  30.71 
 
 		 527 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  31.04 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.82 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  32.83 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  28.25 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.04 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  31.28 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  24.55 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  30.72 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  33.05 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  26.23 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  26.25 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>